У зв'язку з тим, що морські свинки травоїдні, їх кишечник працює дуже своєрідно, де-яка кількість газів завжди може бути присутня, що перешкоджаэ візуалізації органів під час ультразвукового дослідження. Голодування свинкам протипоказано, тому підготовка до УЗД полягає тільки в дієті - по можливості, за 3 дні не давати вологих кормів, обмежитися сіном і невеликою кількістю гранульованого корму. При необхідності лікар може порекомендувати "Еспумізан" або його аналоги.
Якщо УЗД необхідно зробити терміно, то воно проводиться без підготовки.
У більшості випадків всі органи вдається візуалізувати, однак, в деяких випадках, візуалізація все ж частково утруднена.
Шерсть на животі при дослідженні органів черевної порожнини необхідно виголити.  У морських свинок є органи для дослідження яких потрібно видалити шерсть і в інших місцях, наприклад нирки можуть прекрасно визуалізуватися зі сторони спинки, для УЗД грудної порожнини виголюється шерсть в районі грудної клітки.